他克莫司软膏主要成分为他克莫司，而吡美莫司乳膏，主要成份是吡美莫司。

另外，二者在适应症和作用机制上是不同的：

他克莫司软膏，适用于因潜在危险而不宜使用传统疗法、或对传统疗法反应不充分、或无法耐受传统疗法的中到重度特应性皮炎者，作为短期或间歇性长期治疗。0.03%和0.1%浓度的均可用于成人，但只有0.03%浓度的他克莫司软膏可用于2岁及以上的儿童。

吡美莫司乳膏是治疗特应性皮炎早期缓解和长期控制的有效治疗方法。霜剂型，无油腻感，皮肤更干爽。激素类药物如果用多了很容易出现耐药性，这是治疗湿疹时易反复的主要原因。吡美莫司乳膏外用药物主要是激素替代治疗使用，更安全放心。

他克莫司软膏是非糖皮质激素外用免疫调节剂。治疗慢性湿疹具有局部免疫调节、抗炎及止痒作用。他克莫司系属免疫调节剂，结构系大环内酯类，具有相对分子质量小、皮肤渗透性好的特点，适宜于外用。

而吡美莫司乳膏非激素治疗药物，较少的局部刺激，可有效的应用于儿童和头面部等敏感部位。极低的系统吸收率，可以长期使用。可见吡美莫司乳膏可以用于皮肤过敏，它是治疗特应性皮炎早期缓解和长期控制的有效治疗方法。但是同时，吡美莫司乳膏最常见的不良反应是用药局部刺激症状，如烧灼感。这些反应通常发生于治疗早期，一般为轻度或中度，且持续时间短。常见的有用药局部反应刺激、瘙痒、红斑，皮肤感染毛囊炎。

妙手医生温馨提示：如果患者不确定自身症状，可以咨询妙手医生或药师，以便更好用药。